Në zbatim të V.K.M. Nr. 547, datë 09.08.2006 “ Për krijimin e Agjensisë Kombëtare të Burimeve Natyrore”, te ndryshuar me V.K.M. Nr. 202, datë 11.04.2007 “Disa shtesa dhe ndryshime në V.K.M. Nr.547, datë 09.08.2006”, objektivat e veprimtarisë së Drejtorisë Hidroenergjitike janë si më poshtë:

• zbatimi i politikave të Qeverisë në fushën hidroenergjitike,

• konsultimi, propozimi dhe bashkëpunimi, me strukturat përkatëse të Qeverisë, për hartimin e politikave të saj në fushën e hidroenergjitikës,

• sigurimi i oponencës qeveritare për projekt-propozimet e pakërkuara për dhënien e hidrocentraleve me koncesion,

• mbikqyrja e veprimtarisë hidroenergjitike,

• monitorimi i kontratave koncesionre për hidrocentralet